Zdravotní přínos probiotik nesouvisí pouze s použitými kmeny, ale také úzce souvisí s dávkováním. Vědecké výzkumy ukazují, že probiotika mohou kolonizovat, množit se a vyvíjet regulační účinky ve střevech pouze tehdy, jsou-li konzumována v dostatečném množství. To jim umožňuje zlepšit střevní mikroflóru, podpořit trávení a vstřebávání živin nebo posílit imunitu. Účinná dávka se však liší v závislosti na kmeni. Například některé kmeny mohou mít pozitivní účinky při denním příjmu pouhých několika set milionů živých buněk, zatímco jiné vyžadují vyšší množství, aby bylo dosaženo znatelných přínosů.
U stejného kmene v určitém rozmezí je obecně pravděpodobnější, že vyšší dávka přinese významné zdravotní přínosy než dávka nižší. To však neznamená, že „více je vždy lepší“. Překračování doporučené dávky nebude trvale zvyšovat účinek a může dokonce vést k plýtvání nebo v některých případech zvýšit riziko gastrointestinálních potíží.
Navíc, protože různé kmeny mají odlišné vlastnosti a mechanismy účinku, pouhé srovnání počtu živých buněk v produktu neukazuje jeho celkovou účinnost. Vědečtější způsob, jak vyhodnotit účinnost probiotik, je odkázat na klinické důkazy podporující konkrétní kmen, spíše než jen na množství. Při výběru produktů by se spotřebitelé měli zaměřit na kmeny s údaji z klinického výzkumu a autoritativní certifikací a měli by vybírat ty, které vyhovují jejich individuálním potřebám, místo toho, aby slepě pronásledovali vysoké dávky nebo obrovské množství živých bakterií.